Latar Belakang: Kanker kolorektal merupakan salah satu kanker dengan tingkat insiden dan mortalitas tinggi di Indonesia. Penanganan kanker ini menimbulkan beban biaya yang besar, sehingga penting untuk melakukan analisis biaya terapi khususnya pada pasien Jaminan Kesehatan Nasional (JKN). Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis dan mengevaluasi komponen serta besaran biaya nyata yang dikeluarkan untuk terapi rawat inap pasien kanker kolorektal yang dijamin oleh program Jaminan Kesehatan Nasional (JKN). Metode: Penelitian ini menggunakan desain observasional analitik dengan pendekatan cross-sectional dan data sekunder dari rekam medis dan keuangan pasien periode Januari 2022 – Desember 2024. Sampel sebanyak 55 pasien yang memenuhi kriteria inklusi dipilih . Analisis data dilakukan secara deskriptif dan menggunakan uji korelasi Spearman untuk mengetahui faktor yang berhubungan dengan total biaya. Hasil: Rata-rata total biaya pengobatan pasien kemoterapi kanker kolorektal rawat inap JKN di RS PKU Muhammadiyah Gombong adalah Rp57.302.710,49 dengan komponen biaya terbesar berasal dari biaya obat dan alat medis. Sedangkan, rata-rata total biaya pengobatan untuk pasien operasi kanker kolorektal rawat inap JKN di RS PKU Muhammadiyah Gombong adalah Rp10.913.239,53 dengan komponen biaya terbesar berasal dari biaya kamar operasi. Faktor yang berpengaruh signifikan terhadap total biaya pengobatan adalah jenis prosedur (p<0,001) dan total lama rawat inap (p<0,001). Sedangkan regimen kemoterapi, diagnosa, dan jenis kepesertaan BPJS tidak berpengaruh signifikan. Kesimpulan: Jenis prosedur dan lama rawat inap merupakan faktor yang mempengaruhi total biaya pengobatan kanker kolorektal pada pasien JKN. Hasil penelitian ini diharapkan dapat menjadi dasar pertimbangan dalam perencanaan biaya dan efisiensi pembiayaan pelayanan kanker kolorektal di rumah sakit.