Tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui Pola Manajemen Pondok Pesantren dan Pembinaan Keberagamaan Santri di Pondok Pesantren Pendidikan Islam Miftahussalam Banyumas.
Jenis penelitian ini adalah penelitian deskriptif kualitatif, yaitu metode penelitian yang menghasilkan informasi mengenai status suatu gejala yang ada, yaitu keadaan gejala menurut apa adanya pada saat penelitian dilakukan berupa kata-kata tertulis atau lisan dari orang yang diteliti dan perilaku yang bisa diamati. Dalam pengumpulan data menggunakan metode observasi, wawancara dan dokumentasi. Setelah data terkumpul kemudian dianalisis dengan langkah analisis reduksi data, penyajian data, dan penarikan kesimpulan.
Hasil penelitian ini menunjukan bahwa Pola Manajemen Pondok Pesantren ditinjau dari aspek manajerialnya yaitu manajemen kurikulum, manajemen sarana prasarana, manajemen pembiayaan, manajemen ketenaga pendidikan dan bidang keasramaan. Adanya pengaturan manajemen tersebut agar tatan pondok pesantren tersusun secara rapi dan tertib.
Pembinaan keberagaman santri di Pondok Pesantren Pendidikan Islam Miftahussalam Banyumas menggunakan metode hiwar (dialog), metode kisah Qurán dan Nabawi, metode teladan, metode pembiasaan, dan metode ibrah mau‟izah (pelajaran atau pengalaman). Selanjutnya dalam penelitian ini dibuktikan dengan kegiatan santri yaitu dengan adanya pembiasaan Shalat berjama‟ah, pembiasaan Tadarus Al-Qur‟an , Muhadhoroh (kultum), Pembiasaan puasa senin kamis, dan Ta‟lim. Faktor pendukung proses pembinaan keberagamaan ini tidak lain adalah ustadz/ustadzah yang membantu dalam proses pembinaan, kerjasama yang baik dari semua komponen yang ada di pondok dan terjalinya kerjasama yang baik antara pondok dengan orang tua atau wali santri. Faktor penghambat dalam proses pembinaan adalah kurangnya pemahaman orang tua terhadap visi dan misi Pondok Pesantren Pendidikan Islam Miftahussalam Banyumas dan dampak negatif dari perkembangan teknologi informasi dan media massa.