Latar Belakang : Resistensi bakteri terhadap antibiotik mengalami peningkatan
termasuk bakteri yang diisolasi dari lingkungan. Perubahan genetika bakteri
merupakan salah satu penyebab masalah resistensi. Identifikasi bakteri dan
mekanisme resistensinya dapat dilakukan pada tingkat molekuler dengan metode
PCR menggunakan primer universal 16S rRNA.
Tujuan Penelitian : Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi DNA bakteri
multiresisten dengan PCR menggunakan primer universal 16S rRNA.
Metode Penelitian : Jenis penelitian ini adalah analisis eksperimental yaitu
identifikasi DNA bakteri multiresisten dengan PCR menggunakan primer
universal 16S rRNA. Produk PCR sekuen gen 16S rRNA kemudian dianalisis
dengan enzim restriksi HindIII. Fragmen DNA hasil restriksi dibandingkan
dengan referensi pada bank data genom bakteri spesies Bacillus.
Hasil : Amplifikasi sekuen gen 16S rRNA isolat bakteri MG 46 dengan PCR
menggunakan primer universal berukuran ~ 1000 bp. Hasil restriksi dengan enzim
HindIII terhadap produk PCR berupa 3 fragmen berukuran ~ 1000 (hasil produk
PCR yang tidak terpotong), ~ 500 dan ~ 300 bp.
Kesimpulan : Penentuan jenis bakteri belum dapat dilakukan karena perlu
analisis lebih lanjut meliputi sekuensing DNA dan penyelarasan BLAST.