IDENTIFIKASI DNA BAKTERI MULTIRESISTEN GENUS STREPTOCOCCUS ( ISOLAT WK 45 ) DENGAN METODE PCR MENGGUNAKAN PRIMER UNIVERSAL 16S rRNA

FATCHULLOH, HENDRI DINNUR (2013) IDENTIFIKASI DNA BAKTERI MULTIRESISTEN GENUS STREPTOCOCCUS ( ISOLAT WK 45 ) DENGAN METODE PCR MENGGUNAKAN PRIMER UNIVERSAL 16S rRNA. Bachelor thesis, UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH PURWOKERTO.

Preview	Text COVER_HENDRI DINNUR FATCHULLOH_FARMASI'13.pdf Download (920kB) | Preview
Preview	Text BAB I_HENDRI DINNUR FATCHULLOH_FARMASI'13.pdf Download (716kB) | Preview
Preview	Text BAB II_HENDRI DINNUR FATCHULLOH_FARMASI'13.pdf Download (830kB) | Preview
	Text BAB III_HENDRI DINNUR FATCHULLOH_FARMASI'13.pdf Restricted to Repository staff only Download (737kB)
	Text BAB IV_HENDRI DINNUR FATCHULLOH_FARMASI'13.pdf Restricted to Repository staff only Download (765kB)
	Text BAB V_HENDRI DINNUR FATCHULLOH_FARMASI'13.pdf Restricted to Repository staff only Download (624kB)
Preview	Text DAFTAR PUSTAKA_HENDRI DINNUR FATCHULLOH_FARMASI'13.pdf Download (1MB) | Preview
	Text LAMPIRAN_HENDRI DINNUR FATCHULLOH_FARMASI'13.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB)

Abstract

Latar Belakang: Seiring meningkatnya penggunaan antibiotik yang tidak terkontrol maka jumlah bakteri yang resisten terhadap antibiotik semakin bertambah. Dalam upaya penanggulangan dari serangan bakteri resisten, perlu dilakukan deteksi terhadap gen penyandi 16S rRNA bakteri karena mutasi pada gen rRNA sering dijumpai pada bakteri yang resisten terhadap antibiotik. Salah satu teknik dalam mengidentifikasi 16S rRNA bakteri adalah dengan cara menganalisis struktur atau susunan basa DNA. Metode yang digunakan untuk analisis DNA bakteri resisten yaitu dengan amplifikasi DNA melalui metode PCR (Polymerase Chain Reaction). Kemudian hasil amplifikasi dipotong oleh enzim restriksi HindIII untuk memperoleh fragmen DNA. Tujuan Penelitian: Untuk mengidentifikasi hasil pemotongan produk PCR dari 16S rRNA bakteri multiresisten antibotik yang diisolasi dari tanah Rumah Sakit di Purwokerto (isolat WK 45) menggunakan enzim restriksi HindIII. Metode Penelitian: Jenis penelitian ini adalah penelitian eksperimental yaitu mengidentifikasi produk PCR hasil amplifikasi 16S rRNA yang menggunakan primer universal 8F dan 1492R. Hasil amplifikasi produk PCR kemudian dipotong oleh enzim restriksi HindIII. Hasil: Gen 16S rRNA bakteri WK 45 genus Streptococcus memiliki ukuran 1600 bp. Berdasarkan data yang diperoleh dari NCBI (National Center for Biotechnology Information) terhadap beberapa bakteri genus Streptococcus, bakteri yang dipotong oleh enzim restriksi HindIII pada gen 16S rRNA dengan fragmen pengenal 5’- AAGCTT-3’. HindIII dapat memotong gen 16S rRNA pada bakteri Streptococcus pneumoniae isolate 19-5-F pada dua tempat pemotongan dan juga ada beberapa contoh bakteri strain lain yang tidak terpotong. Hasil penelitian menunjukkan HindIII tidak berhasil memotong gen 16S rRNA, kemungkinan adanya mutasi pada sekuen gen 16S rRNA sehingga tidak dikenali lagi oleh HindIII. Kesimpulan: Gen 16S rRNA pada bakteri dari isolat WK 45 diduga mengalami mutasi pada daerah pemotongan enzim HindIII. Mutasi tersebut diduga berkaitan dengan resistensi bakteri. Kemungkinan juga bakteri tersebut merupakan bakteri jenis spesies Streptococcus tertentu.

Actions (login required)

View Item