Kedelai (Glycine max (L.) Merr) merupakan salah satu komoditi pangan utama setelah padi dan jagung bagi masyarakat Indonesia. Kebutuhan kedelai tiap tahunnya terus meningkat seiring dengan pertambahan jumlah penduduk namun produktivitas tanaman kedelai di Indonesia masih tergolong rendah. Rendahnya produktivitas tanaman kedelai di Indonesia salah satunya disebabkan karena serangan penyakit karat daun yang disebabkan oleh cendawan Phakopsora pachyrhizi. Cara pengendalian penyakit karat yang umunya digunakan petani adalah menggunakan fungisida sintetik namun hal ini tidak ramah lingkungan sehingga dibutuhkan alternatif lain yang ramah lingkungan. Salah satu alternatif yang digunakan untuk mengendalikan penyakit karat adalah dengan menggunakan agensia hayati. Tujuan penelitian untuk mengetahui kemampuan ketahan beberapa varietas kedelai umur sedang didaerah dataran rendah yang diuji melalui pemberian agensia hayati. Penelitian dilakukan secara eksperimen menggunakan Rancangan Acak Lengkap (RAL) dua faktor. Faktor pertama adalah varietas kedelai yaitu varietas Argomulyo, Kaba dan Devon 1 serta faktor kedua adalah perlakuan agensia hayati yang terdiri dari perlakuan kontrol, perlakuan agensia hayati PGPR, dan perlakuan agensia hayati Coryne dengan ulangan sebanyak 3 kali. Parameter yang diamati meliputi diameter batang, diameter tajuk, tinggi tanaman, jumlah polong per tanaman, jumlah biji per tanaman, bobot biji per tanaman, bobot 100 butir biji per tanaman, intensitas serangan penyakit karat. Parameter pendukung meliputi suhu dan kelembaban udara. Data dianalisis menggunakan uji F, apabila berpengaruh nyata kemudian dilajutkan dengan uji lanjut Duncan Multiple Range Test (DMRT) pada taraf kepercayaan 5%. Hasil penelitian menunjukkan bahwa perlakuan varietas kedelai sangat berpengaruh nyata pada pertumbuhan vegetative dan generative kecuali pada diameter batang. Perlakuan agensia hayati tidak berpengaruh nyata pada pertumbuhan vegetative dan generative. Terjadi interaksi nyata antara varietas kedelai dan agensia hayati pada intensitas penyakit karat. Varietas Devon 1 yang diaplikasikan