Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi dan mengidentifikasi bakteri
probiotik pada organ pencernaan (lambung dan unsus) ikan Patin (Pangasius
hypophthalmus). Penelitian telah dilaksanakan pada bulan Agustus – November
2016. Isolasi dilakukan dengan mengambil bagian organ lambung dan usus ikan
Patin. Seleksi bakteri probiotik dilakukan dengan memasukkan organ lambung
dan usus ikan Patin kedalam larutan NaCl 0,9% pH 2 kemudian diencerkan pada
pengenceran 10-1 dilanjutkan menanam secara pour plate pada medium Tryptone
Soya Agar. Isolat murni yang diperoleh sebanyak 7 isolat, kemudian
diidentifikasi berdasarkan pengamatan makroskopis sel, mikroskopis sel, dan uji
biokimia aktivitas sel bakteri.Isolat bakteri diidenfikasi menggunakan buku
Bergey’s Manual Determinative of Bacteriologgy (Holt et al., 1994). Hasil
identifikasi terdapat 5 genus bakteri diantaranya Enterobacter, Bacillus,
Pseudomonas, Neisseria, dan Azomonas. Kelima genus tersebut ketika di uji
antagonistik terhadap bakteri patogen (Aeromonas hydrophylla) genus Azomonas
tidak dapat menghambat bakteri A. hydrophylla. Berdasarkan hasil penelitian, 7
isolat bakteri memiliki potensi sebagai bakteri probiotik.